根据邓小平的指示，当天下午，杨尚昆主持了中央军委会议，为北京市区的戒严进行兵力部署，中央军委组成人员除邓小平、赵紫阳外，杨尚昆、洪学智、刘华清、秦基伟、杨白冰、迟浩田、赵南起全都出席了会议。会后，杨尚昆、刘华清、迟浩田立即向邓小平报告。现根据中央军委办公厅、中共中央办公厅的有关材料综述。
杨尚昆：“小平同志，根据您的指示，我刚刚主持开了会，学智、华清、秦部长、浩田、白冰、南起同志都参加了，对戒严的决定大家表示坚决拥护并不折不扣地坚决执行。经过研究，决定这次戒严的主要任务由北京军区、沈阳军区、济南军区承担，其它军区配合，成立戒严部队指挥部。戒严部队指挥部由华清、浩田和周衣冰（北京军区司令员）组成，直接对中央军委负责，兵力部署由中央军委统一指挥。”
邓小平：“戒严以后北京市区有多少解放军呀？”
杨尚昆：”解放军和武装警察的全部兵力为十八万人。”接着，杨尚昆将中央军委调集北京执行戒严任务的兵力部署报告递交给邓小平。
以邓小平名义拟定的命令写道：
根据中华人民共和国宪法第八十九条第十六项的规定，国务院决定，自一九八九年五月二十一日起在北京市部分地区实行戒严。为配合完成这次在北京市部分地区实行戒严的任务，兹命令北京军区的北京卫戍区、二十四军、二十七军、二十八军、三十八军、六十三军、六十五军，沈阳军区的三十九军、四十军，济南军区的五十四军、六十七军的有关部队分别于五月十九日、五月二十日自驻地进驻北京地区的有关目的地。
在邓小平签署进军令后，杨尚昆指示总参谋长迟浩曰立即与北京、沈阳、济南军区的司令员们磋商，“确定每一集团军的有关师团进京名单，进军具体时间，到达目的地时间，戒严主要事项等实施细则”；同时，命令总政治部主任杨白冰立即以总政治部名义向各大军区发布政治动员令，要求“在党和国家面临严峻形势的情况下，各大军区必须纪律严明，随时作好准备，绝对服从党中央、中央军委的统一行动和指挥”；命令总后勤部部长赵南起“调集好戒严必须的一切军用战备物资、粮食，并与北京市委、市政府磋商，尽可能地解决好部队的食宿给养问题”。
进京命令发布的当天晚上，发生了一件让杨尚昆等军委领导人极其震惊的事情。北京军区司令员周衣冰向杨尚昆紧急报告。周衣冰说：“杨主席，刚刚得到三十八军的报告，该军军长徐勤先不能执行进京戒严的命令。”杨尚昆：”这件事可开不得玩笑！这是军令！不执行军令是要依军法论处的。三十八军别人（指军党委成员）的态度呢？”周衣冰回答：“大多数人表示坚决执行军委命令。”“不行。这件事大意不得。你得马上亲自去一趟。一定要做徐勤先的工作。告诉他，想得通想不通是一回事，执行命令又是一回事。”星夜，周衣冰等开车前往三十八军的驻地保定。